Renesanční zámeček je nejstarší zachovalou stavební památkou v Kyjově. Nechal jej postavit kolem roku 1540 tehdejší pán Kyjova, moravský zemský hejtman Jan Kuna z Kunštátu. Zámeček sloužil jako sídlo pánů Kyjova, po r. 1548 se stal majetkem města. V r. 1636 část budovy, přiléhající k bývalému hřbitovu, vyhořela a byla přestavěna. Po třicetileté válce byla v budově s největší pravděpodobností fara. V 19. století sloužil jako kasárny pro kavalérii (asi 1880). V roce 1911 dala kyjovská obec zámeček uvnitř i zevně opravit. Z tohoto roku také pocházejí sgrafita, jejichž autorem je akademický malíř Jano Köhler. Letopočty na fasádě připomínají nejdůležitější data z dějin Kyjova a Köhler zde zachytil i vlastní podobu.
V roce 1928 se muzejní sbírky stěhovaly do přízemí zámečku. Po r. 1951 získalo celou budovu muzeum, které zde sídlí dodnes.